利用簡化測序對大豆進化關系及重要農藝性狀的基因定位研究

Domestication footprints anchor genomic regions of agronomic importance in soybeans.

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研究背景:

分為兩個重點,一是國內外材料在馴化路徑上的一個驗證,野生,馴化和半馴化的關系;二是國內材料馴化的路徑及方向,半馴化群體向北向南分別馴化為完全馴化群體;

研究目的:

對大豆進化關系及重要農藝性狀的基因定位

材料方法:

材料:大豆,一共3個群體,完全馴化群體FD(404株),半馴化群體SD(36株)和野生型群體ND(72株),其中,其他國家的材料占(42株),我們國家的材料占(470株),

材料和方法:一共3個群體,完全馴化群體FD(404株),半馴化群體SD(36株)和野生型群體ND(72株),其中,其他國家的材料占(42株),我們國家的材料占(470株)

SLAF簡化測序

技術路線:

 

實驗結果:

1)基于SNP,用EIGENSOFT軟件,進行主成分分析(Principal?components?analysis-PCA),得到512個大豆樣品的主成分聚類情況。不同的顏色代表不同的群體,每個點代表一個樣本,相同顏色的聚到了一起,說明遺傳背景比較接近。圖中結果展示FD、ND和SD三個群體各自聚類;進化樹的結果與PCA一致。